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Expresión diferencial de microARNs en cv. Chardonnay en respuesta al ataque por "Diaporthe" spp.

Los microRNAs (miRNAs) son pequeños RNA no codificantes, reguladores de la expresión génica a nivel post-transcripcional. Su funcionamiento está basado en la degradación o represión de la traducción de sus transcritos diana. La función reguladora de los miRNAs en el desarrollo de plantas ha sido ampliamente estudiada, sin embargo, la información sobre el papel de los miRNAs en la respuesta de defensa frente a patógenos es más limitada. En este trabajo, se buscaron miARNs diferencialmente expresados en respuesta a la infección por Diaporthe bohemiae y Diapohrte eres, dos especies fúngicas asociadas a la enfermedad de la madera ‘Phomopsis dieback’, en el cultivar Chardonnay en condiciones controladas. Para ello, se utilizaron métodos computacionales para predecir y anotar presuntos miARN diana con el objetivo de investigar su implicación en las posibles rutas de respuesta al ataque del patógeno. Se construyeron librerías de ARNs pequeños a partir de muestras de tejidos de vid cultivar Chardonnay inoculados con ambos patógenos, y se secuenciaron utilizando técnicas de secuenciación de nueva generación (MiniSeq de Illumina). Se identificaron 136 secuencias variantes de miRNA conocidas y 41 nuevas, probablemente generadas a través de modificaciones post-transcripcionales. En el caso de las plantas inoculadas con D. eres, se identificaron 61 miARN conocidos y 17 nuevos, mientras que en plantas inoculadas con D. bohemiae, se identificaron 101 miARN conocidos y 21 nuevos. Para validar los resultados de la secuenciación, se cuantificó la expresión de estos miARNs mediante RT-qPCR. Los resultados de este estudio contribuyen a mejorar el conocimiento sobre el rol de los miARNs durante el proceso de infección por Diaporthe spp. en vid, lo cual resulta clave para entender el desarrollo de síntomas externos de la enfermedad en la planta.

El estudio ha sido realizado por David Gramaje del grupo BIOVITIS del ICVV en colaboración con investigadores de la Universidad de Mendel (República Checa) y la Universidad de Agricultura de Cracovia (Polonia).

Este estudio se ha publicado recientemente en la revista Genes. Más información:

https://www.mdpi.com/2073-4425/10/11/905