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Genética y Genómica de la Vid (Vitigen)

Componentes del grupo: 
José Miguel Martínez Zapater : 
Profesor de Investigación CSIC
Javier Ibáñez: 
Científico Titular CSIC
Jerome Grimplet: 
Investigador Ramón y Cajal, CSIC
Pablo Carbonell: 
Investigador contratado
Carolina Royo: 
Investigadora contratada
Maite Rodríguez Lorenzo: 
Investigadora en formación
Mª Ignacia Montemayor: 
Especialista I+D+I
Miguel Angulo: 
Auxiliar de Investigación I+D+I
Silvia Hernáiz: 
Técnico de laboratorio contratada
Líneas de investigación

Nuestro grupo de investigación está interesado en conocer los mecanismos genéticos y moleculares responsables del desarrollo reproductivo de la vid. En particular nuestra actividad se centra en caracteres que tienen un impacto importante en la producción y en la calidad de la uva y del vino.

Nuestra aproximación se basa en explorar, caracterizar y utilizar la variación genética natural que existe en la vid para estos caracteres y en desarrollar y emplear herramientas genéticas y genómicas que permitan llegar a conocer la base genética y molecular de la variación fenotípica observada.

Para ello desarrollamos dos líneas de actividad principales:

1. Prospección, obtención, conservación y caracterización genética y fenotípica de recursos genéticos de vid: plantas silvestres, variedades, variantes somáticas y progenies segregantes. A corto plazo el objetivo es disponer de nuevos recursos genéticos para el estudio del control genético de caracteres agronómicos relevantes, incluyendo la búsqueda de variantes somáticas, la generación de progenies de cruzamientos y autofecundaciones, la prospección de variedades y la creación de colecciones nucleares. La utilidad de estos recursos pasa por su correcto genotipado, a través del uso de marcadores moleculares (SNPs y/o microsatélites), y fenotipado para los caracteres de interés, relacionados con el desarrollo reproductivo.

2. Estudio de la base molecular de la variación para caracteres de interés agronómico. Entre ellos se incluyen la fertilidad, la precocidad, la floración y el cuajado, la arquitectura y compacidad del racimo, el color, el tamaño y la forma de la baya o la presencia de semillas. El objetivo consiste en la búsqueda de genes y polimorfismos genéticos responsables de la variación natural para estos caracteres utilizando los recursos genéticos disponibles y herramientas como la transcriptómica, genómica, análisis de QTLs y de asociación genética.

Las herramientas y el conocimiento generado tienen aplicación directa inmediata en la identificación varietal o en el seguimiento del desarrollo de la vid o de su respuesta a distintas condiciones ambientales o de cultivo. Asimismo son de aplicación en los programas de selección de clones y de obtención de nuevas variedades, así como en la mejora de las prácticas culturales, todo ello enfocado a dar respuesta a los nuevos retos de la viticultura presente y futura.

Publicaciones recientes

Carbonell-Bejerano, P., V. Rodríguez, S. Hernáiz, C. Royo, S. Dal Santo, M. Pezzotti, and J.M. Martínez-Zapater. 2016. Reducing sampling bias in molecular studies of grapevine fruit ripening: transcriptomic assessment of the density sorting method. Theor. Exp. Plant Physiol. 28:109-129. doi: 10.1007/s40626-016-0059-5.

Grimplet, J., P. Agudelo-Romero, R.T. Teixeira, J.M. Martínez-Zapater, and A.M. Fortes. 2016. Structural and Functional Analysis of the GRAS Gene Family in Grapevine Indicates a Role of GRAS Proteins in the Control of Development and Stress Responses. Frontiers in Plant Science 7:22. doi: 10.3389/fpls.2016.00353.

Grimplet, J., J.M. Martínez-Zapater, and M.J. Carmona. 2016. Structural and functional annotation of the MADS-box transcription factor family in grapevine. BMC Genomics 17:80. doi: 10.1186/s12864-016-2398-7.

Ibáñez, J., J. Carreño, J. Yuste, and J.M. Martínez-Zapater. 2015. Grapevine breeding and clonal selection programmes in Spain. In Grapevine Breeding Programs for the Wine Industry. A. Reynolds (ed.), pp. 183-209. Woodhead Publishing, Oxford.

Royo, C., P. Carbonell-Bejerano, R. Torres-Perez, A. Nebish, O. Martinez, M. Rey, R. Aroutiounian, J. Ibáñez, and J.M. Martínez-Zapater. 2016. Developmental, transcriptome, and genetic alterations associated with parthenocarpy in the grapevine seedless somatic variant Corinto bianco. J. Exp. Bot. 67:259-273. doi: 10.1093/jxb/erv452.

Tello, J., R. Aguirrezábal, S. Hernáiz, B. Larreina, M.I. Montemayor, E. Vaquero, and J. Ibáñez. 2015. Multicultivar and multivariate study of the natural variation for grapevine bunch compactness. Aust. J. Grape Wine Res. 21:277-289. doi: 10.1111/ajgw.12121.

Tello, J., R. Torres-Pérez, J. Grimplet, P. Carbonell-Bejerano, J.M. Martínez-Zapater, and J. Ibáñez. 2015. Polymorphisms and minihaplotypes in the VvNAC26 gene associate with berry size variation in grapevine. BMC Plant Biol. 15:1-19. doi: 10.1186/s12870-015-0622-2.

Tello, J., R. Torres-Pérez, J. Grimplet, and J. Ibáñez. 2016. Association analysis of grapevine bunch traits using a comprehensive approach. Theor. Appl. Genet. 119:227-242. doi: 10.1007/s00122-015-2623-9.

Vargas, A.M., M.T. de Andrés, and J. Ibáñez. 2016. Maximization of minority classes in core collections designed for association studies. Tree Genet. Genomes 12. doi: 10.1007/s11295-016-0988-9

Zinelabidine, L.H., J. Cunha, J.E. Eiras-Dias, F. Cabello, J.M. Martinez-Zapater, and J. Ibáñez. 2015. Pedigree analysis of the Spanish grapevine cultivar 'Heben'. Vitis 54:81-86.