The ICVV is structured into two Research Departments and has various research and support services, as well as several Associated Research Units.

• Viticulture
• Oenology

• Instrumental Analysis
• Experimental Winery
• Cultivations

• Management and administration
• Library and documentation
• Information and communication technologies

The ICVV also has an internal Biological Safety Commission.

• Name: Laboratorio de Análisis del Aroma y Enología (LAAE)
• Participants:
  • Universidad de Zaragoza
  • Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino - ICVV (CSIC, Gobierno de La Rioja, Universidad de la Rioja)

• Name: Unidad Asociada Eficiencia en el uso del agua de la vid (UIB)
• Participants:
  • Universidad de Baleares
  • Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino - ICVV (CSIC, Gobierno de La Rioja, Universidad de la Rioja)

• Name: Unidad Asociada UvaMox (Universidad de Valladolid)
• Participants:
  • Universidad de Valladolid
  • Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino - ICVV (CSIC, Gobierno de La Rioja, Universidad de la Rioja)

• Name: Enfermedades Infecciosas, Microbiota y Metabolismo (CIBIR)
• Participants:
  • Centro de Investigación Biomédica de La Rioja (CIBIR)
  • Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino - ICVV (CSIC, Gobierno de La Rioja, Universidad de la Rioja)

• Name: CropQuality: Estreses en los cultivos y sus efectos en la calidad (Universidad de Santiago de Compostela)
• Participants:
  • Universidad de Santiago de Compostela (USC)
  • Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino - ICVV (CSIC, Gobierno de La Rioja, Universidad de la Rioja)

• Name: Grupo de Bioquímica, Biofísica y Biología Computacional
• Participants:
  • Universidad de Zaragoza
  • Estación Experimental Aula Dei - EEAD (CSIC)
  • Instituto de Ciencias de la Vid y del Vino - ICVV (CSIC, Gobierno de La Rioja, Universidad de la Rioja)