Biología Molecular, Celular y Bioinformática
Funciones principales
- Prestaciones a investigadores del ICVV y externos en materia de bioinformática, bioestadística y biología molecular y celular.
- Asesoramiento en nuevas tecnologías ómicas y digitales aplicadas a ciencias de la vid y del vino.
- Gestión de una plataforma de bioinformática, análisis de datos y modelización para la vitivinicultura.
- Mantenimiento de recursos computacionales centrales del ICVV y asesoramiento en el acceso a recursos externos.
- Mantenimiento y gestión de equipamiento común del ICVV en biología molecular y celular.
Equipamiento y software
- Servidor Hidalgo: bullx R423E4 con 2 nodes Es-2660 (20x 2.6 GHz CPU, 32 TB).
- Software de bioinformática estructural:
- Propio:
- Externo:
- Servidores web de bioinformática estructural:
- PCR en tiempo real qPCR Applied Biosystems 7500.
- Citómetro de flujo Cytoflex (Beckman).
- Lector de placas TECAN.
- Microscopio DIC y de fluorescencia Nikon NI-E.
- Estereomicroscopio Zeiss Discovery V20.
- Ultracentrífuga Optima XE (Beckman).
- Secuenciador de tercera generación MinION (Oxford Nanopore).
- Espectrofotómetro Nanodrop.
- Fluorómetro Qubit.
Servicios disponibles
- Bioinformática estructural: modelado molecular, predicción mediante AlphaFold, ingeniería y diseño de proteínas, docking y reconocimiento molecular, dinámica molecular, análisis funcional, servicios web de modelado y caracterización de interacciones, impacto de variantes.
- Bioinformática genómica (Análisis de datos ómicos): ensamblaje de genomas, anotación de genomas, identificación de variantes genéticas, análisis transcriptómico de expresión diferencial.
- Bioestadística y modelización: análisis estadísticos, métodos de aprendizaje automático, predictores multi-paramétricos, modelos de dinámicas poblacionales.
- Asesoramiento para el acceso a recursos computacionales del centro y otros disponibles en el CSIC (CESGA, DRAGO).
- Asesoramiento en el manejo e interpretación del equipamiento de biología molecular y celular del Servicio.
- Cinéticas microbiana y enzimática en microplaca (TECAN).
- Genotipado e identificación varietal de vid (microsatélites y SNP; con servicio externo).
- Cuantificación de biomoléculas (Nanodrop y Qubit).
Funcionamiento, acceso y otros aspectos prácticos
- Catálogo actualizado 2024 de prestaciones y tarifas para usuarios del ICVV, así como para todos los Institutos CSIC (incluyendo el ICVV), y otros centros y empresas externos al CSIC (contactar con el Servicio).
- Formulario de solicitud de prestaciones del servicio (contactar con el Servicio).
- Calendario de reserva de los equipos del Servicio (contactar con el Servicio).