Un conjunto de investigadores del ICVV han realizado por primera vez un estudio de asociación que analiza la base genética del comportamiento reproductivo de la vid cultivada, utilizando para ello una colección de variedades de vid de distinto origen y uso con elevada diversidad fenotípica para caracteres tan relevantes como la tasa de cuajado, corrimiento, o millerandage.
El estudio, publicado en la revista Plant Science, analiza la relación existente entre dicha diversidad fenotípica y la variación genética presente en los más de 15000 SNPs (polimorfismos que afectan a un único nucleótido) detectados en la secuencia genética de 289 genes candidatos. Estos genes se seleccionaron y secuenciaron en base a experimentos previos realizados en el ICVV o en base a su función descrita en otras especies vegetales modelo. Los resultados obtenidos han permitido acotar el número de genes candidatos a 34, los cuales presentan una serie de SNPs estadísticamente asociados con los caracteres analizados. Entre estos SNPs asociados, cabe destacar aquellos localizados en la secuencia de factores de transcripción tipo MADS, una familia de genes que modulan la expresión de otros genes con una función específica en el control del proceso de floración y del desarrollo reproductivo de la vid.
Este trabajo ha sido posible gracias a la financiación del MINECO (AGL2014-59171-R), la AEI (BIO2017-86375-R), la convocatoria Juan de la Cierva Incorporación (IJC2018-035036-I) y el programa COST Action CA17111 INTEGRAPE, así como a la contribución del Gobierno de La Rioja y su personal por el mantenimiento de la colección de variedades de la Finca La Grajera.
Más información:
Zinelabidine, L.H., Torres-Pérez, R., Grimplet, J., Baroja, E., Ibáñez, S., Carbonell-Bejerano, P., Martínez-Zapater, J.M., Ibáñez, J., Tello, J. (2021). Genetic variation and association analyses identify genes linked to fruit set-related traits in grapevine. Plant Science, 306:110875.
https://doi.org/10.1016/j.plantsci.2021.110875
